MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-03 plasmid pAPA03-010

Total Repeats: 2833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017101	GCG	2	6	168026	168031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384049517
2502	NC_017101	TCG	2	6	168151	168156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384049517
2503	NC_017101	GAA	2	6	168176	168181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384049517
2504	NC_017101	TCA	2	6	168193	168198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384049517
2505	NC_017101	CTT	2	6	168233	168238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384049517
2506	NC_017101	C	6	6	168267	168272	0 %	0 %	0 %	100 %	384049517
2507	NC_017101	TGGT	2	8	168292	168299	0 %	50 %	50 %	0 %	384049517
2508	NC_017101	GCCA	2	8	168364	168371	25 %	0 %	25 %	50 %	384049517
2509	NC_017101	AC	3	6	168424	168429	50 %	0 %	0 %	50 %	384049517
2510	NC_017101	CGA	2	6	168464	168469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049517
2511	NC_017101	TG	3	6	168639	168644	0 %	50 %	50 %	0 %	384049517
2512	NC_017101	CCGC	2	8	168655	168662	0 %	0 %	25 %	75 %	384049517
2513	NC_017101	CAC	2	6	168663	168668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384049517
2514	NC_017101	TG	3	6	168711	168716	0 %	50 %	50 %	0 %	384049517
2515	NC_017101	CCG	2	6	168970	168975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384049517
2516	NC_017101	GAT	2	6	168981	168986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384049517
2517	NC_017101	T	6	6	168998	169003	0 %	100 %	0 %	0 %	384049517
2518	NC_017101	TGC	2	6	169354	169359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384049518
2519	NC_017101	TGC	2	6	169362	169367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384049518
2520	NC_017101	CGG	2	6	169420	169425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384049518
2521	NC_017101	CAC	2	6	169522	169527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384049518
2522	NC_017101	GGT	2	6	169561	169566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384049518
2523	NC_017101	CAC	3	9	169575	169583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384049518
2524	NC_017101	GGAT	2	8	169638	169645	25 %	25 %	50 %	0 %	384049518
2525	NC_017101	CAG	2	6	169779	169784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049518
2526	NC_017101	CGA	2	6	169828	169833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049518
2527	NC_017101	GCT	2	6	169874	169879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384049518
2528	NC_017101	GGCA	2	8	169914	169921	25 %	0 %	50 %	25 %	384049518
2529	NC_017101	GAT	2	6	169922	169927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384049518
2530	NC_017101	GCC	3	9	170071	170079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384049518
2531	NC_017101	CG	3	6	170098	170103	0 %	0 %	50 %	50 %	384049518
2532	NC_017101	TGG	2	6	170134	170139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384049518
2533	NC_017101	GCA	2	6	170219	170224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049518
2534	NC_017101	ACG	2	6	170268	170273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049518
2535	NC_017101	CCA	2	6	170276	170281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384049518
2536	NC_017101	GAA	2	6	170343	170348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384049518
2537	NC_017101	CGT	2	6	170384	170389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384049518
2538	NC_017101	CA	3	6	170399	170404	50 %	0 %	0 %	50 %	384049518
2539	NC_017101	CAC	2	6	170430	170435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384049518
2540	NC_017101	GCC	2	6	170436	170441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384049518
2541	NC_017101	TGAG	2	8	170500	170507	25 %	25 %	50 %	0 %	384049519
2542	NC_017101	TTTC	2	8	170530	170537	0 %	75 %	0 %	25 %	384049519
2543	NC_017101	CAG	2	6	170657	170662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049519
2544	NC_017101	CAGC	2	8	170687	170694	25 %	0 %	25 %	50 %	384049519
2545	NC_017101	CAG	2	6	170786	170791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049519
2546	NC_017101	GCA	2	6	170814	170819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049519
2547	NC_017101	GT	3	6	171063	171068	0 %	50 %	50 %	0 %	384049519
2548	NC_017101	CCA	2	6	171069	171074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384049519
2549	NC_017101	GCC	2	6	171132	171137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384049519
2550	NC_017101	CCA	2	6	171163	171168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384049519
2551	NC_017101	GCC	2	6	171182	171187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384049519
2552	NC_017101	CGC	2	6	171220	171225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384049519
2553	NC_017101	CAG	2	6	171284	171289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049519
2554	NC_017101	GCCATC	2	12	171296	171307	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384049519
2555	NC_017101	AG	3	6	171399	171404	50 %	0 %	50 %	0 %	384049519
2556	NC_017101	GTG	2	6	171432	171437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384049519
2557	NC_017101	CAT	2	6	171449	171454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384049519
2558	NC_017101	GCA	2	6	171483	171488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049520
2559	NC_017101	GAA	2	6	171601	171606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384049520
2560	NC_017101	CA	3	6	171749	171754	50 %	0 %	0 %	50 %	384049520
2561	NC_017101	TCCGG	2	10	171792	171801	0 %	20 %	40 %	40 %	384049520
2562	NC_017101	GCA	2	6	171814	171819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049520
2563	NC_017101	GGC	2	6	171820	171825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384049520
2564	NC_017101	ATG	2	6	171827	171832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384049520
2565	NC_017101	TCA	2	6	171845	171850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384049520
2566	NC_017101	TCGCG	2	10	171852	171861	0 %	20 %	40 %	40 %	384049520
2567	NC_017101	CGG	2	6	171905	171910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384049520
2568	NC_017101	ACA	2	6	171956	171961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384049520
2569	NC_017101	CCCGG	2	10	172059	172068	0 %	0 %	40 %	60 %	384049521
2570	NC_017101	CAC	2	6	172194	172199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384049521
2571	NC_017101	TCT	2	6	172376	172381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384049521
2572	NC_017101	CTGC	2	8	172388	172395	0 %	25 %	25 %	50 %	384049521
2573	NC_017101	GGC	2	6	172398	172403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384049521
2574	NC_017101	GGC	2	6	172471	172476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384049521
2575	NC_017101	CCG	2	6	172505	172510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384049521
2576	NC_017101	GCA	2	6	172543	172548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049521
2577	NC_017101	GTC	2	6	172576	172581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384049521
2578	NC_017101	CAG	2	6	172613	172618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049521
2579	NC_017101	GTCCG	2	10	172663	172672	0 %	20 %	40 %	40 %	384049521
2580	NC_017101	GCCC	2	8	172864	172871	0 %	0 %	25 %	75 %	384049521
2581	NC_017101	AGC	2	6	172879	172884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049521
2582	NC_017101	TGC	2	6	172930	172935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384049521
2583	NC_017101	GC	3	6	172934	172939	0 %	0 %	50 %	50 %	384049521
2584	NC_017101	GCC	2	6	173028	173033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384049521
2585	NC_017101	GCC	2	6	173188	173193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384049522
2586	NC_017101	CAT	2	6	173246	173251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384049522
2587	NC_017101	GA	3	6	173344	173349	50 %	0 %	50 %	0 %	384049522
2588	NC_017101	AGC	2	6	173362	173367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049522
2589	NC_017101	CTC	2	6	173368	173373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384049522
2590	NC_017101	TGATC	2	10	173413	173422	20 %	40 %	20 %	20 %	384049522
2591	NC_017101	TGA	2	6	173475	173480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384049522
2592	NC_017101	CCA	2	6	173518	173523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384049522
2593	NC_017101	TTC	2	6	173552	173557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384049522
2594	NC_017101	TCA	2	6	173566	173571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384049522
2595	NC_017101	GC	3	6	173579	173584	0 %	0 %	50 %	50 %	384049522
2596	NC_017101	CCA	2	6	173641	173646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384049522
2597	NC_017101	ACG	2	6	173799	173804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049522
2598	NC_017101	CCA	2	6	173833	173838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384049522
2599	NC_017101	ATG	2	6	173859	173864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384049522
2600	NC_017101	CGC	2	6	173893	173898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384049522
2601	NC_017101	GCTG	2	8	173910	173917	0 %	25 %	50 %	25 %	384049522
2602	NC_017101	CGG	2	6	173986	173991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384049522
2603	NC_017101	GCA	2	6	174066	174071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049522
2604	NC_017101	AG	3	6	174118	174123	50 %	0 %	50 %	0 %	384049523
2605	NC_017101	ACG	2	6	174152	174157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049523
2606	NC_017101	AGG	2	6	174162	174167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384049523
2607	NC_017101	GGCA	2	8	174259	174266	25 %	0 %	50 %	25 %	384049523
2608	NC_017101	GCC	2	6	174275	174280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384049523
2609	NC_017101	AAT	2	6	174287	174292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384049523
2610	NC_017101	TTG	2	6	174306	174311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384049523
2611	NC_017101	TCA	2	6	174336	174341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384049523
2612	NC_017101	CAG	2	6	174392	174397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384049523
2613	NC_017101	TAA	2	6	174490	174495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384049523
2614	NC_017101	GAA	2	6	174977	174982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384049524
2615	NC_017101	ACACC	2	10	174986	174995	40 %	0 %	0 %	60 %	384049524
2616	NC_017101	TTC	2	6	175005	175010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384049524
2617	NC_017101	TGC	2	6	175017	175022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384049524
2618	NC_017101	GC	5	10	175047	175056	0 %	0 %	50 %	50 %	384049524
2619	NC_017101	TGG	2	6	175059	175064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384049524
2620	NC_017101	CAC	2	6	175067	175072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384049524
2621	NC_017101	CCA	2	6	175146	175151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384049524
2622	NC_017101	GAA	2	6	175262	175267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384049524
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2743	NC_017101	CGTC	2	8	183603	183610	0 %	25 %	25 %	50 %	384049530
2744	NC_017101	TGTCC	2	10	183615	183624	0 %	40 %	20 %	40 %	384049530
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2747	NC_017101	CGGG	2	8	183917	183924	0 %	0 %	75 %	25 %	384049531
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2833	NC_017101	C	6	6	190028	190033	0 %	0 %	0 %	100 %	384049534

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.